Naslovna  > Znanost > Projekti financirani sredstvima Hrvatske zaklade za znanost > HRZZ > Otkrivanje biomarkera za bolest Hashimotov tireoiditis koristeći multi-omics pristup

Naziv HRZZ Istraživačkog projekta:
Otkrivanje biomarkera za bolest Hashimotov tireoiditis koristeći multi-omics pristup
 
Akronim projekta: HT-OMICS
Trajanje projekta:  31.12.2023. - 30.12.2027.
Voditelj projekta: prof. dr. sc. Vesna Boraska Perica

Suradnici na projektu: 
prof. dr. sc. Ante Punda,
doc. dr. sc. Ana Barić Žižić,
doc. dr. sc. Vesela Torlak Lovrić,
dr. sc. Dean Kaličanin,
dr. sc. Maja Cvek,
Marko Vuletić, dr. med.,
Vanna Žnidar, univ. mag. math.,
Ivana Listeš, univ. mag. biol. mol.,
prof. dr. sc. Eleftheria Zeggini,
dr. sc. So-Youn Shin
 


 

Opis projekta:

Hashimotov tireoiditis (HT) je najučestalija autoimuna bolest današnjice. Molekularni mehanizmi u podlozi bolesti još uvijek nisu dovoljno poznati, stoga je ovaj projekt usmjeren na otkrivanje novih znanja vezanih uz molekularne i biološke putove vezane uz HT. Ovaj projekt predstavlja nastavak prethodne HRZZ Uspostavne potpore u kojoj je osnovana CRO-HT biobanka bioloških uzoraka i fenotipova za 500 ispitanika oboljelih od HT-a te je provedena cjelogenomska analiza povezanosti (GWAS). U međuvremenu smo prikupili još 200 kontrolnih ispitanika te u predloženom projektu kroz cilj 1 (C1 Proširenje CROHT biobanke) planiramo uključiti dodatnih 200 ispitanika s HT-om te genotipizirati njihov genom. Također, planiramo mjeriti i analizirati proteinske i metaboličke markere kroz ciljeve 2 (C2 Otkrivanje biomarkera koristeći proteomsko profiliranje) i 3 (C3 Otkrivanje biomarkera koristeći metabolomsko profiliranje). Kroz ove ciljeve ćemo nastojati: (a) identificirati različito izražene proteinske/metaboličke markere između HT ispitanika i kontrola i ispitati povezanost omics profila s težinom bolesti HT; (b) utvrditi povezanosti između značajnih markera i kliničkih obilježja HT-a; (c) integrirati sve dostupne omics podatke (cjelogenomske genotipove, proteom i metabolom) da bi dobili bolji uvid u manifestaciju same bolesti; (d) ispitati postojanje uzročnih povezanosti između značajnih markera (metabolita i proteina) i HT-a koristeći metodu Mendelove randomizacije. Kroz posljednji cilj 4 (C4 Istraživanje uloge crijevne propusnosti s HT-om) planiramo mjerenje i analiziranje proteina zonulina  koji je trenutno jedini mjerljivi marker crijevne propusnosti. Predloženi sveobuhvatni istraživački pristup pridonijet će razumijevanju temeljnih bioloških putova povezanih s mehanizmima nastanka HT-a i identifikaciji biomarkera koji mogu služiti pri stvaranju prediktivnih modela za razvoj te do razvoja novih terapijskih, prevencijskih i dijagnostičkih metoda.

 

 

Znanstveni radovi:

1) Boraska Perica V, Barić Žižić A, Sladić S, Vuletić M, Listeš I, Kaličanin D, Žnidar V, Čikeš Čulić V, Torlak Lovrić V, Punda A, Škrabić V, Barbalić M. Non-Coding Structural Variants in Regulatory Regions and High Polygenic Burden May Jointly Contribute to Early-Onset Familial Hashimoto's Thyroiditis. Genes (Basel). 2026 Oct 20;17(10):1303. doi: 10.3390/genes17101303. PMID: 42938419; PMCID: PMC13704020.

2) Kaličanin D, Žnidar V, Listeš I, Cvek M, Barić Žižić A, Vuletić M, Sladić S, Micek VE, Torlak Lovrić V, Punda A, Boraska Perica V. Association of Vitamin D Levels and Systemic Inflammation in Patients with Hashimoto's Thyroiditis. Diseases. 2026 Sep 20;14(9):349. doi: 10.3390/diseases14090349. PMID : 42783242; PMCID: PMC13605515.
Ovaj rad je istaknut na naslovnici časopisa Diseases:

 

Pozvana predavanja:

Prikaz bolesnika: Povećana učestalost Hashimotovog tireoiditisa u pojedinim obiteljima - kako i zašto?
23. TEČAJ TRAJNOG MEDICINSKOG USAVRŠAVANJA: „ŠEĆERNA BOLEST U DJECE I ODABRANE TEME IZ PEDIJATRIJSKE ENDOKRINOLOGIJE“, Zagreb 5.-7.11.2026.
 prof. dr. sc. Veselin Škrabić, dr. med.

 

   prof. dr. sc. Vesna Boraska Perica

 

Kongresni sažeci:

1. Ivana Listeš, Vanna Žnidar, Dean Kaličanin, Ana Barić Žižić, Marko Vuletić, Sanda Sladić, Vesela Torlak Lovrić, Maja Cvek, Ante Punda, Vesna Boraska Perica. ^"NMR-based metabolomic phenotyping reveals XXL VLDL remodeling as a quantitative signature of Hashimoto's thyroiditis persisting beyond biochemical euthyroidism”. American Society of Human Genetics Conference (ASHG), 20-24 Listopada 2026, Montreal, Kanada. 

 Ivana Listeš, univ. mag. biol. mol. - poster

2. Vanna Žnidar, Vesna Boraska Perica, Ana Barić Žižić, Sanda Sladić, Marko Vuletić, Ivana Listeš, Dean Kaličanin, Vedrana Čikeš Čulić, Vesela Torlak Lovrić, Ante Punda, Veselin Škrabić, Maja Barbalić. ^"Whole-Exome and Long-Read Sequencing Reveal a Complex Genomic Architecture of Early-Onset Hashimoto's Thyroiditis in a Multi-Generational Family”. American Society of Human Genetics Conference (ASHG), 20-24 Listopada 2026, Montreal, Kanada. 

 Vanna Žnidar, univ. mag. math. - poster

 

 Vanna Žnidar, univ. mag. math. i prof. dr. sc. Vesna Boraska Perica - Poster

Doktorati:

Doktorandica mr. sc. Maja Cvek, dipl. ing. je 25. kolovoza 2025. uspješno obranila doktorsku disertaciju pod naslovom „Analiza vitamina D i kalcitonina u ispitanika iz Hrvatske biobanke pacijenata s Hashimotovim tireoiditisom“ pod mentorstvom prof. Vesne Boraska Perica

 Maja Cvek, dr. sc. i mentorica prof. dr. sc. Vesna Boraska Perica

 

Usavršavanja:

 

Vanna Žnidar i njezin tim sudionika na Volos Summer School of Human Genetics 2025.