BIOMARK-AI
Primjena metabolomike i strojnog učenja u predikciji biomarkera za Hashimotov tireoiditis i parodontitis (IP-UNIST-34)
Naziv projekta: Primjena metabolomike i strojnog učenja u predikciji biomarkera za Hashimotov tireoiditis i parodontitis (IP-UNIST-34)
Naziv prijavitelja projekta: Sveučilište u Splitu, Medicinski fakultet
Vrijednost projekta: 238.041,20 EUR
Trajanje projekta: 1/10/2025 - 30/09/2029
Voditeljica projekta: prof. dr. sc. Vesna Boraska Perica (vboraska@mefst.hr)
Opis projekta:
Metabolomika omogućuje sveobuhvatan uvid u biokemijske promjene povezane s fiziološkim i patološkim stanjima organizma. U okviru ovog projekta analizirat će se metabolom bolesnika s Hashimotovim tireoiditisom (HT) i parodontitisom (PD), dvjema kroničnim upalnim bolestima koje dijele niz imunoloških i okolišnih čimbenika rizika. Cilj je identificirati metaboličke biomarkere karakteristične za svaku bolest zasebno, ali i zajedničke metabolite koji mogu ukazivati na srodne patofiziološke mehanizme.
Metaboliti će se kvantificirati korištenjem napredne platforme za mjerenje 5400 metabolita, dok će se statističkim metodama odrediti metaboliti sa značajnom razlikom u ekspresiji između zdravih i oboljelih ispitanika te oni povezani s kliničkim fenotipovima. Primjenom algoritama strojnog učenja, posebice Boruta metode za selekciju značajki, razvijat će se prediktivni modeli za identifikaciju ključnih metabolita povezanih s bolestima HT i PD i njihovom progresijom.
Projekt okuplja znanstvenike različitih profila te potiče suradnju među sastavnicama Sveučilišta, čime će se osigurati prijenos znanja i razvoj kompetencija. Poseban naglasak stavlja se na korištenje napredne istraživačke infrastrukture i digitalnih tehnologija, što će omogućiti obradu i analizu velikih skupova podataka. Očekivani rezultati uključuju objavu znanstvenih radova, razvoj novih metodoloških pristupa te jačanje digitalnih kapaciteta. Projekt također predviđa održivost rezultata kroz otvoreni pristup podacima i nastavak korištenja razvijenih resursa nakon završetka projekta.
Ciljevi projekta:
- Radni paket 1 (cilj 1): Identifikacija metaboličkih markera za bolest HT
- Radni paket 2 (cilj 2): Identifikacija metaboličkih markera za bolest PD
- Radni paket 3 (cilj 3): Integrirani pristup za određivanje metabolita zajedničkih za bolesti HT i PD
- Radni paket 4 (cilj 4): Primjena strojnog učenja pri određivanju prediktivnih markera za prisutnost i jačinu bolesti HT i PD
Suradnici:
HT grupa:
Prof. dr. sc. BORASKA PERICA VESNA
Dr. sc. KALIČANIN DEAN
Prof. dr. sc. DRMIĆ HOFMAN IRENA
Prof. dr. sc. MARKOTIĆ ANITA
Doc. dr. sc. MASTELIĆ ANGELA
Doc. dr. sc. TANDARA LEIDA
Doc. dr. sc. BARIĆ ŽIŽIĆ ANA
Prof. dr. sc. RADMAN MAJA
Izv. prof. dr. sc. BRATANIĆ ANDRE
Izv. prof. dr. sc. BONACIN DAMIR
Doc. dr. sc. ŠUNDOV DINKA
Doc. dr. sc. ZEKIĆ TOMAŠ SANDRA
Izv. prof. dr. sc. FRANIĆ TOMISLAV
Izv. prof. dr. sc. BOBAN NATAŠA
Doc. dr. sc. BAČIĆ BORIS
Doc. dr. sc. MEŠTROVIĆ ZORAN
Izv. prof. dr. sc. LEDINA DRAGAN
Izv. prof. dr. sc. BOBAN MARIJO
Izv. prof. dr. sc. PETRIĆ MIŠE BRANKA
Izv. prof. dr. sc. LOZIĆ BERNARDA
PD grupa:
Doc. dr. sc. ROGULJIĆ MARIJA
Izv. prof. dr. sc. KERO DARKO
Dr. sc. DUPLANČIĆ ROKO
Izv. prof. dr. sc. TADIN ANTONIJA
Izv. prof. dr. sc. REŽIĆ MUŽINIĆ NIKOLINA
Dr. sc. LOZIĆ MIRELA
Prof. dr. sc. GOIĆ BARIŠIĆ IVANA
Doc. dr. sc. NOVAK ANITA
Izv. prof. dr. sc. ŠTULA IVANA
Izv. prof. dr. sc. LOVRIĆ KOJUNDŽIĆ SANJA
Ispiši stranicu
